从基因遗传的角度来看，不推荐同一窝的猫，因为近亲繁殖容易引起后代猫基因遗传性疾病，这种疾病与其他不同，几乎无法治愈，因此为了子孙猫的健康，主人在给猫配种时，建议确定血缘关系，避免同一窝的猫配种。
猫每天交配不得超过2次，每次需要间隔10小时以上。母猫一般每2~3周发情1次，发情期持续6~10天，适合交配的时间为发情期间的3~4天，发现母猫阴门红肿、湿润、翻转，阴门内有血样粘液流出时，可以选择适当的公猫交配，不能外出自己交配。
主人要事先找到同种类的猫，让两只猫一个人呆一会儿，让母猫接受公猫，提高母猫的妊娠。母猫一般每隔2~3周发情一次，发情期持续6~10天，适合交配的时间为发情期中间的3~4天。猫咪配种时主人可以悄悄观察它们的配种情况，注意每天交配不得超过2次。
猫的发情期为7天，一般从猫的发情第二天开始配种，每天配一次，直到发情期结束。猫咪发情交配后会刺激卵巢在24到48小时内排卵，所以至少需要连续五到六天进行配种。如果只配种三天，很可能成熟的卵子还没有排出，导致配种失败。如果配种太晚，成熟的卵子排出太晚也有可能导致配种失败，因此猫的配种至少需要5到6天。
猫配种时，公猫爬上母猫，持续几分钟左右。公母猫交配结束后，母猫自然会远离公猫，这样他们第一次配种就结束。猫完成配种后，可以仔细观察母猫是否有舔屁的行为，如果发生这种行为，一般表示配种成功。一般来说，公共母猫在一起大约需要一两天。
母猫的发情期一般为7天，母猫在与公猫交配后24~48小时刺激排卵，因此一般母猫的发情从第二天开始交配，连续5~6天交配。公猫选择品种合适的公猫，公猫处于发情期。公猫没有发情也没关系。因为公猫随时都能被母猫刺激。但是，要注意配种的环境是公猫熟悉的，母猫和公猫在配种前必须相互熟悉。
配种对母狗来说，可以延缓子宫脓液的发生，可以减少狗因发情而迷路的风险。母狗发情后长期不种子容易患子宫脓等生殖道疾病，公狗不配种容易失去发情。如果主人不想让狗繁殖，建议发情后绝育，如果繁殖，建议发情时给狗配种。
公猫和母猫交配怀孕的次数与当时公猫和母猫的身体状况有关。一般来说，猫发情后的第二天可以带猫去配种，怀孕的概率最高，主人可以让公猫和母猫在同一个房间，主人尽量不要打扰。一般来说，两天左右就可以了。主人不必数猫交配的次数，主人在旁边反而会引起猫的不适应。
不建议同窝猫繁殖。同窝猫属于兄妹猫，不应该交配繁殖，因为猫之间也有近亲繁殖。近亲繁殖的幼猫大多不健康，同窝猫一直生长在发情期间可能会发生同窝交配的现象，为了避免这种情况，猫在发情期间主人可以分别饲养，或者尽快绝育。
一般来说，建议猫在一岁以上进行配种，或者在第二次发情时进行配种。因为一岁以下的猫和第一次发情的猫的身体生殖器官没有完全发育，所以这个时候进行配种，母猫怀孕生孩子的话，会伤害母猫的身体，生孩子的胎儿身体也不强，今后的配种成功率会下降。
