猫公母的不同主要通过生殖器官的不同来区分。母猫特有的生殖器官是子宫、卵巢、阴道，公猫特有的生殖器官是睾丸、阴茎。另外，公猫和母猫外生殖器的形态结构和位置也不同，母猫外生殖器呈扁平形，开口大，接近肛门位置，公猫外生殖器呈圆柱状，开口小，接近肛门位置。
根据猫的生殖器来判断，公猫和母猫都有乳头，不能根据这种现象来判断。首先提起猫尾，尾巴根部下面有个洞，是用来拉大便的，然后在这个洞的正下方大约有一厘米左右的另一个洞，两个洞成一条直线，距离相近，这是母猫。公猫两个洞的距离相距有点远，两个洞之间留有睾丸放置的空间。
在发育不成熟之前很难区分猫的公母，特别是新生的小猫，一般通过外生殖器口和肛门的相对位置和形态来判断。小母猫的外生殖器口通常离肛门很近，小公猫的外生殖器口离肛门很远，一般小母猫的外生殖器口像水滴或长的倒三角，小公猫的生殖器口更圆。
