中亚牧羊犬风湿性关节炎早期症状为游走性跛行、关节周围软组织肿胀、精神抑郁、发热、厌食，犬跛行重而轻，反复发作。在中亚牧羊犬风湿性关节炎中期，由于反复复发，关节软骨进一步受到侵蚀，出现关节周围骨质疏松，软骨清晰，肿胀。类风湿关节炎晚期关节腔变窄，边缘糜烂，不完全脱位，完全脱位。
中亚牧羊犬风湿性关节炎的早期症状有行走跛行、关节周围软组织肿胀、抑郁、发热、厌食等。中亚牧羊犬风湿性关节炎中期，由于反复复发，关节软骨进一步被侵蚀，导致骨质疏松、软骨下透明、肿胀。类风湿关节炎晚期关节腔变窄，边缘糜烂，不完全脱位和完全脱位。
中亚牧羊犬坏死性胰腺炎的主要表现为呕吐、腹泻，甚至出血，伴有上腹部疼痛、弓背姿势。如果生化测试能发现脂肪酶和淀粉酶都比正常值高很多。如果是重症胰腺炎，还可能发现黄疸征象，结膜和皮肤呈黄色，甚至继发肾损害或衰竭，所以一定要及时治疗，不要耽误。
中亚牧羊犬冠状病毒的病因可能是狗妈妈在孕期感染了冠状病毒，没有产生抗体，通过脐带血传播。或者小狗在哺乳期间被狗妈妈间接性传播。或者中亚牧羊犬生活在有冠状病毒的环境中。这也可能是中亚牧羊犬在外出玩耍时接触到带有冠状病毒的狗狗。主要原因是中亚牧羊犬抵抗力低的时候病毒入侵。
中亚牧羊犬狗瘟热眼炎的治疗原则是抗病毒和大量输注。在具体治疗犬瘟热的同时，要对症清洁眼睛，使用抗菌眼药水，如润康、国乐等。继发性结膜炎常发生在犬瘟热病毒感染后，导致结膜潮红，眼睑肿胀，早期眼部分泌物增多但相对较薄，逐渐演变为化脓性分泌物，导致上下眼睑常粘连在一起。
中亚牧羊犬轻度脑炎的症状以意识障碍为特征。生病中亚牧羊犬可以表现出兴奋或高度抑郁，甚至不认识主人。有些狗不停地吠叫，漫无目的地奔跑，与障碍物相撞。有的狗掉头就退，局部或全身痉挛性抽搐。情绪低落的动物头部下垂，眼睛半闭，头顶障碍物不动，对外界反应迟钝，姿势不正确，肌肉无力，一些生病的狗昏昏欲睡地倒在地上。
中亚牧羊犬的慢性支气管炎的特点是经常咳嗽，可能打喷嚏。此外，还会伴随呼吸道粘液增多，导致中亚牧羊犬呼吸困难，加快犬的呼吸频率。建议犬在呼吸道痰液不能排出时，考虑雾化治疗。
患有胃炎症的中亚牧羊犬可能会出现抑郁、胃痛、胀气、厌恶触摸、食欲不振、呕吐、腹泻等症状。治疗过程中应禁食、饮水，但可加适量生理盐水。要查明病因，以免再次刺激胃肠道，加重症状，导致脱水消瘦。
肛腺囊肿发炎的狗狗经常甩尾巴，用屁股蹭地板，试图咬肛门，排便困难，不允许摸屁股。中亚牧羊犬的肛门肿了，有一股难闻的气味。当炎症严重时，会流出黄色分泌物并混入脓液。建议清洗肛腺，注射消炎药。严重的中亚牧羊犬需要全身抗感染治疗。康复后，每次洗澡都要清洗肛门腺。
中亚牧羊犬的指间炎症的常见症状是脚趾或脚的其他部位之间长出一个小包。一开始，它和粉刺一样大，然后它变得越来越大。严重时会破裂，脓或血会流出。因为肿胀和疼痛，狗不敢在地上行走，它看起来像是跛行的。这种脓肿可能长在一个脚趾之间，也可能在几个脚趾之间发炎。皮肤颜色会变红，脚趾附近的头发也会变色。
