中亚牧羊犬指甲需要定期修剪。中亚牧羊犬大约两个月大的时候就开始剪指甲了。如果长时间不修剪指甲，指甲会逐渐弯曲，甚至嵌入肉垫。因此，中亚牧羊犬很容易滑倒，行走不稳，久而久之会对关节造成负担。
中亚牧羊犬可以在三个月内开始补钙。缺钙对中亚牧羊犬的发育有很大影响。主人需要为宠物购买专门的钙片，根据宠物的体重喂养，并用微量元素和卵磷脂喂养宠物。卵磷脂可以滋养头发，使狗的头发更加柔顺。不要喂人也不要喂零食。
医用紫外线可以杀死冠状病毒。犬冠状病毒病是犬类常见的传染病之一。犬冠状病毒病治愈率较高。常用的消毒方法有定期使用84消毒剂、新洁尔灭、甲酚皂喷雾、紫外线灯照射等，临床症状以消瘦、腹泻、脱水为主。常见的消除方法有定期消毒和分犬开放喂养、饲料清洁和饮水、定期驱虫等。
注意保暖，每天定时消毒，保持空气流通，给患副流感的中亚牧羊犬补充足够的水分。体温升高的狗可以口服退烧药。化痰止咳颗粒可用于治疗严重咳嗽。但最重要的是体温。发高烧一定要控制，否则会导致呼吸衰竭，治愈率很低。
中亚牧羊犬需要打狂犬疫苗，可以防止中亚牧羊犬得狂犬病。大多数中亚牧羊犬都是狂犬病病毒携带者，不打疫苗很容易生病。狗用疫苗有三种，狂犬病疫苗和疾病预防疫苗。正常情况下，犬约6至9周龄开始接种，可一次性注射多种疫苗。
犬瘟热是一种急性病毒性传染病，临床治疗较为复杂，尤其是在犬瘟热感染后期，因此不建议在家治疗。因为国内治疗条件有限，治疗犬瘟热需要使用大量的生物制剂。同时，宠物主人缺乏相关医学知识，很容易导致病情加重，甚至加速中亚牧羊犬的死亡。
犬瘟热、犬细小病毒、犬冠状病毒引起的中亚牧羊犬病毒性肠炎，有3 ~ 5天的危险期，与病毒的毒力、中亚牧羊犬的免疫力、病程有关。肠炎通常分为细菌性肠炎和病毒性肠炎，其中大肠杆菌和沙门氏菌引起的细菌性肠炎可通过合理、科学的治疗痊愈，一般无危险期。
惊厥、颤抖和站立不稳的主要原因是脑膜脑炎、癫痫、颅内寄生虫和中毒。前三种情况发病时间相对较长，而中毒导致犬出现上述症状的时间相对较短。鉴于中亚牧羊犬症状严重，建议及时带中亚牧羊犬去宠物医院检查治疗。
中亚牧羊犬癣的治疗原则包括局部用药和全身治疗。首先要清洁中亚牧羊犬中亚牧羊犬患处周围的毛发，清洁多余的头皮屑和痂，然后局部使用含有特比萘芬等成分的外用喷雾剂。如果病情严重或真菌传播范围广，还需要口服含有伊曲康唑的抗真菌药物和具有抗真菌作用的外用洗发水。
疫苗是灭活或减毒的病毒，因此中亚牧羊犬在接种疫苗后可能处于不良的精神状态。这是正常情况，主人也不要太担心。只要中亚牧羊犬没有出现呕吐、戒断、肿胀等过敏反应，中亚牧羊犬的精神状态在接种1天后就会恢复正常。
